Город Кронштадт находится на острове Котлин, занимая лишь его четвертую часть. Город сохранился со времен Петра Великого, по замыслу огражденный со всех сторон крепостной стеной. В 1824 году было наводнение, уничтожившее постройки города, которые были заново отстроены в петровском стиле.
Начало городу положил форт Кроншлот, который находился рядом с островом Котлин, на мелководье уже в 1704 году.
В тот период шла война между Швецией и Россией. История Петербурга начиналась с закладки Петропавловской крепости (16 мая 1703 года). Система обороны, созданная на Неве у стен Адмиралтейства, позволяла шведам подходить к городу и вести бой практически прямой наводкой. История Балтийского флота берет свое начало от даты 7 мая 1703 года, когда на одном из притоков Невы появились два шведских корабля для ведения разведки. Петр I понимал, что есть необходимость отодвинуться дальше в море от вновь строившегося города Петербурга и обустроить новую линию обороны возле острова Котлин. Оценив наличие в этих местах фарватера и мели, Петр принимает решение поставить на этой мели маленький деревянный форт, который бы своими пушками смог отсечь возможность прорыва шведских войск. Так началось строительство форта Кроншлот в феврале-марте 1704 года, что в переводе означало «коронный зАмок» или «Коронный замОк». Это первая русская крепость на Балтике, которая заперла беспрепятственный проход противника в сторону устья Невы.
На южном берегу начали валить лес, а тесаные бревна тащить в сторону фарватеров, в сторону этого мелководья. Собирать здесь огромные деревянные срубы (ряжи), наполнять их камнями, срубом, мусором, делать некие дома без окон, без дверей. Своей массой эти ряжи продавливали лед, уходя под воду, давая основание этому искусственному острову. Далее посыпали грунтом и возвели трёхъярусную деревянную башню, рассчитанную для размещения пятидесяти орудий. Строился форт в великой тайне и по модели, которую прислал Петр из Воронежа Меньшикову. Из журнала Петра Великого известная точная дата освещения форта — 7 мая 1704 года, 14.00. Среди архитекторов форта принято считать Петра и великого мастера Трезини, который в то время занимался строительством Петербурга, и подключился к строительству форта.
Через трое суток в форт подвезли первые пушки. К началу навигации форт успели полностью вооружить. Когда сюда пребывает шведская эскадра, зимовавшая в Выборге, то вместо свободного прохода в сторону Невы и строящегося Петербурга, шведы перед собой обнаруживают нечто, открывшее по ним огонь. Впервые по этому маршруту Викингов (путь из Варяг в Греки) противник в сторону Невы пройти не смог.
В 1705 году шведы высадились на остров Котлин с целью разведки. Из-за погодных условий не смогли дойти до форта, но тем не менее, сделали разведывательные рисунки форта. В следующий свой поход шведы уже ведут себя более активно. Подошедшая эскадра ведет перестрелку с фортом Кроншлот, добивается нескольких попаданий и гибели тринадцати артиллеристов. Предпринимается две попытки высадки дисанта. Обе попытки были неудачные. При первой попытке было побито порядка 60 шведов. Во второй попытке потери были 1:10 не в пользу шведов. Эта маленькая башня форта Кроншлот была постепенно разобрана. К форту была пристроена небольшая гавань. Спустя еще 100 лет, в середине XIX века, строится каменная Николаевская батарея, вмещающая 98 орудий, обращенных на запад. В таком виде форт существует и до сих пор.
Кроме форта Кроншлот при Петре I был построен еще один форт, носивший название «Цитадель». Сам город был обнесен крепостной стеной, земельно-деревянными валовыми укреплениями. В таком виде крепость оставалась до наводнения 1824 года. С усовершенствованием артиллерии, линия обороны продвигалась все дальше и дальше в море. Сегодня это самая большая крепость, обустроенная на искусственных островах. Вокруг острова Котлин можно насчитать еще 17 маленьких искусственных островов, на которых стояли форты.
Сначала Петр большее внимание уделял системе фортов, обороны. Постепенно здесь стала формироваться военно-морская база. Строительство жилых домов, зданий. Возник комплекс из 47 жилых домов, включая каменный дворец Петра Великого (сохранялся до конца XIX века в Летнем саду) и дворец Меньшикова. Появляются Петровские ДОКи в городе. В 1719 году здесь возникают две дамбы, где ремонтируются корабли. В 1752 году ДОКи вступают в строй. В 1777 году сюда привозят одни из первых огневых машин.
В отличии от Петербурга в Кронштадте было три дворца: загородный дворец (территория современной дачи Верещагина), дворец на Ряже (территория современного арсенала), домик Петра I, который сохранялся до конца XIX века.
Следующая серьезная перестройка была связана с трагедией наводнения в 1824 году, когда в Петербурге вода поднялась за 4 метра, в Кронштадте до 3,6 метров. После этого наводнения город представлял из себя корабельное кладбище. Почти все корабли утонули или были выброшены в город. Крепость была размыта. Для защиты Петербурга в итоге не стало ничего. Погибло 76 человек. Началось восстановление крепости в камне, затем флот и город. Был создан комитет по устранению Кронштадта, деятельность которого курировал как инженер Николай I. Строятся новые архитектурные сооружения, водопровод, многие из зданий существуют и сегодня.
К середине XIX века были перестроены все деревянные сооружения в камне, что позволило держать удар противника в будущем. Выставлялись морские мины, на которых подрывались английские и французские корабли. Это дало понять противнику, что дальше будет только хуже.
Среди фортов комплекса: Форт Александр I имел возможность круговой обороны; самым большим фортом XIX века была форт Павел I. На территории одного форта была организована противочумная станция. Объектом исследования была чума, скарлатина, сибирская язва. Для микробиологов были созданы все условия: уединенность, оборона, зоопарк (животный мир Российской Империи для исследований). Этот форт называли Чумный. Еще один форт представлял из себя госпиталь, где была сделана первая в России операция на сердце.
